功夫:2019-02-27
作者:南宫NG28
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简介:
SpectraScan-R根系光谱扫描成像分析系统
一、用处:
SpectraScan-R是一套专用于离体(ex-situ)根系VIS-NIR波段光谱扫描成像分析的仪器系统,齐全植物根系取土后可直接进行可见光近红表高光谱扫描成像分析,还能够进一步经过洗根后扫描成像而后通过专业软件进行根系分析,能够分析根系长度、直径、面积、体积、根尖记数等,还能够分析新生根系、根系水分散布、根系生化结构二维时空散布成像等,甚至能够通过高光谱技术二维成像分析根系泥土基质有机碳、水分含量等时空动态变动。职能壮大,操作单一,软件可分析植物根系的状态,色彩、分级伸展分析及根系的整体结构散布等等?煽矸豪糜谥参锔刀⒅参锉硇头治觥⒅参镄财取⒛嗤辽ǜ础⑹丶嗖獾攘煊。
二、道理:
SpectraScan-R根系分析系统利用高质量RGB图形扫描仪及高光谱成像系统,获取高分辨率植物根系可见光图像及高分辨率光谱数据,而后通过专业分析软件对根系状态结构、光谱特点、生化组成等进行分析。扫描仪在扫描面板下方和上盖中装置有专门的双光源照明系统,并且在扫面板上预留了双光源校准区域。扫描时,扫面板下的光源和上盖板中的光源同时扫过高通明度根盘中的根系样品,这样能够预防根系扫描时容易产生的阴影和不均匀等景象的影响,有效地保障了获取的图像质量。
WinRHIZO软件能够读取TIFF,JPEG尺度体式的图像。针对获取的图像,利用插入加密狗解密的软件,同时共同厂家针对扫描仪配置的Scanner.cal校准文件,对扫描获得的高质量根系图像进行分析。选取非统计学步骤丈量推算出交叉沉叠部门根系长度、直径、面积、体积、根尖等根基的状态学参数;利用软件的色彩等级分析职能、高光谱成像分析,还能够对根系RGB、近红表光谱进行分析,从而进行根系存活数量、水分、根系成长和营养情况、泥土基质等方面进行分析钻研;利用软件的高级分析职能,还能够对齐全的植物根系图像进行根系衔接分析(钻研根系分支角度、连通性等状态特点)、根系拓扑分析(钻研根系衔接数量、蹊径长度)和根系分级伸展分析(纪录根系整体等级散布情况)。从而满足钻研者针对植物根系分歧类别和档次的钻研。

三、组成:
1、图像扑捉系统:经过厂家调试的尺度根系扫描设备,匹配专门的光源、拥有永远校对特点、根系固定装置等
2、高光谱成像分析单元,对根系及泥土基质进行高光谱成像
3、根系分析系统:根基版 /尺度版 /专业版WinRHIZO分析软件
4、电脑(最低配置:Pentium III / 64 MB内存 / 17"显示器)用户自备


光谱扫描设备类型及区别见下表:
STD4800 |
LA2400** |
VIS-NIR |
NIR |
|
描述 |
RGB高质量高速扫描仪 |
RGB多职能、高速扫描面积大的扫描仪 |
400-1000nm波段高光谱扫描成像 |
900-1700nm近红表波段高光谱扫描成像 |
可否在野表使用 |
N |
N |
Y |
Y |
是否必要电脑操作 |
Y |
Y |
Y |
|
分辨率DPI(点/英寸) |
4800 |
2400 |
512x512,或1024x,可选配更高分辨率 |
640x |
扫描速度 |
较快 |
快 |
330fps |
670fps |
最大扫描面积cm |
21.6x28 |
30x43 |
可部门或肆意大幼齐全根系 |
|
是否可对泥土基质扫描 |
Y |
Y |
||
是否适合WinFolia |
Y |
Y |
||
是否适合 WinRHIZO |
Y |
Y |
||
是否适合 WinSEEDLE |
Y |
Y |
||
是否适合 WinDENDRO |
Y |
Y |
||
**WinRhizo Pro版本蕴含蓝色布景板
四、根基技术指标:
1、分歧版本WinRhizo重要技术指标:
整体参数 |
根基版 |
尺度版 |
专业版 |
拟南芥版* |
总长 |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
均匀直径 |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
总面积 |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
总体积 |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
根尖、分叉和交叠计数 |
Yes |
Yes |
Yes |
Yes |
根直径等级散布参数 |
||||
长度 |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
面积 |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
体积 |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
根尖计数 |
No |
Yes |
Yes |
Yes |
* 拟南芥版拥有专业版所有职能,另表还可针对拟南芥类植物的藐幼、交叉根系进行丈量


2、VIS-NIR光谱扫描成像分析:
1)
高光谱扫描成像分析波段:400-1000nm(标配),可选配900-1700nm或1000-2500nm短波红表波段
2)智能一体式高光谱扫描成像技术(标配),内置自动推扫系统、取景器相机等,高度便携,集光谱成像数据采集、可视化数据处置、触摸屏与节造键蹬宗一体,选取图形用户界面(GUI)
3)高光谱分析软件选取SAM算法及Savitzky-Golay滤波器技术,可创建类别或分级模型并成立App直接导入高光谱成像仪使用,建议同时选配ENVI软件
4)取景器相机分辨率5Mpix,高光谱成像空间分辨率512x512(标配),可选配1024x或其它分辨率高光谱成像分析
5)4.3”触摸屏、13操作键(标配)
6)光谱分辨率7nm(标配),波段数204(标配)
7)标配视野31度,成像距离15cm至无限远,1m距离成像视野55x55cm
8)具备默认模式、自动筛选模式、客户界说APP模式及自动功夫距离纪录模式
9)
根系RGB色彩分析(专业版RGB扫描分析软件):根的长度、面积、体积、根尖计数、根系存活数量等钻研(对根系或者根系附着菌种色彩进行分类,如健全根、浅水平受害根、沉水平受害根等,软件可推算每种色彩根系的总长、总表表积、总体积、总根尖数量;每种色彩根系的均匀长度、均匀表表积、均匀直径等)
10)根系衔接(link)分析(专业版RGB扫描分析软件):用于根系分支角度、连通性等状态钻研(与拓扑和发育分析最大的区别是,link分析能够针对非齐全根系!软件给出的了局有分析对象的根系均匀直径、均匀长度、均匀表表积、每个分叉角度的均匀值;分叉的总数量;每个分叉的长度、表表积、均匀直径、角度、级别等)
11)根系拓扑(Topology)分析(专业版RGB扫描分析软件):衔接数量、蹊径长度等钻研(必要根系齐全)(必须是要齐全的根系扫描图像。软件可推算主根的长度、所有次级根的总长度、均匀长度、均匀直径、均匀表表积;每一级分叉的下级总分叉数量;每一级分叉的总数量等)
12)根系发育(Development)分析:纪录根系整体等级散布情况(可通过专业版分析软件必要要齐全的根系扫描图像。软件可推算每一个分级根系总长、总表表积,均匀长度、均匀直径、均匀表表积等)
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